More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0234 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 255 aa  531  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1784  hypothetical protein  44.76 
 
 		 264 aa  211  5.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0213  polysaccharide deacetylase  45.23 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.497622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  33.05 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  28.68 
 
 		 241 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  30.37 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 279 aa  72  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 		 283 aa  72  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.97 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  28.03 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  27.32 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  29.59 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.82 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  46.94 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  25.75 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  41.46 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  30.97 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  33.71 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  40.58 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  28.79 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  37.8 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  26.63 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  43.75 
 
 		 752 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  24.75 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  25.33 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 425 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  25.83 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl558  putative chitin deacetylase  40.62 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 290 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  24.24 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 289 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  40.3 
 
 		 405 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  32.1 
 
 		 320 aa  53.9  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  32.76 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  40.28 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  47.92 
 
 		 397 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  44 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  26.89 
 
 		 308 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  36.59 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0571  polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 		 309 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 		 298 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 320 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 		 287 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  36.27 
 
 		 481 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  48.89 
 
 		 302 aa  52.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  26.9 
 
 		 298 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.93 
 
 		 271 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 248 aa  52  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  24.27 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  31.58 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  43.64 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  29.31 
 
 		 309 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  41.18 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 		 292 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  41.18 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  35.37 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  27.97 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 542 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  34.94 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 		 1120 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  39.34 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  27.12 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  35.21 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>