More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5051 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 273 aa  558  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  39.92 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  37.65 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  36.72 
 
 		 297 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  36.43 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  36.4 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  33.2 
 
 		 288 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.03 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.71 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  32.33 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  32.33 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  31.95 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  31.95 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  32.02 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  31.42 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 291 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  32.55 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  29.96 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  29.6 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  27.43 
 
 		 293 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 		 319 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  33.6 
 
 		 296 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  26.94 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  28.29 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  27.78 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.92 
 
 		 295 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  27.43 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  32.34 
 
 		 326 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09327  conserved hypothetical protein  25.51 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  26.58 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  28.4 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 309 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  30.59 
 
 		 318 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  31.54 
 
 		 317 aa  92.8  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  27.39 
 
 		 308 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  27.39 
 
 		 308 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  27.11 
 
 		 312 aa  92  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  27.39 
 
 		 308 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.39 
 
 		 308 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  26.97 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  29.15 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  25.29 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30682  predicted protein  27.84 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673385  normal  0.0672265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  29.15 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  29.88 
 
 		 336 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  30 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  30.83 
 
 		 317 aa  89.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  30.83 
 
 		 317 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 359 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4116  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  30.83 
 
 		 317 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  29.2 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  29.48 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  30.42 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  30.42 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  29.1 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  30.09 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  26.99 
 
 		 336 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  26.99 
 
 		 336 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  30.12 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  30.12 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  30.12 
 
 		 317 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  30.12 
 
 		 317 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>