More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1730 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 241 aa  499  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  28.68 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.36 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 		 283 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 		 289 aa  85.1  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  33.33 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  33.33 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  32.49 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  28.57 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  32.68 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  32.68 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  32.68 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  30.05 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  34.06 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  27.83 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  31.45 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  25.5 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  27.39 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  26.05 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  28.65 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  32.88 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 281 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  30.26 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  28.26 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  35.24 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.17 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  32.06 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  25.77 
 
 		 296 aa  72  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  34.26 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37.37 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  24.26 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  27.11 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  36.45 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37.38 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  30.08 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.51 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1784  hypothetical protein  25.46 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  36.45 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000107726 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  36.45 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.85 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  33.77 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.19 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  33.93 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  27.38 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  33.08 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 296 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  30.95 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  23.85 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  59.57 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  31.85 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  32.48 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>