More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2005 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  53.26 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  46.43 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  50 
 
 		 293 aa  275  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  51.44 
 
 		 304 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  50.91 
 
 		 302 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  50.36 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  49.64 
 
 		 279 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  49.28 
 
 		 279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  50.19 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  47.69 
 
 		 292 aa  265  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  49.82 
 
 		 279 aa  265  5.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  48.58 
 
 		 298 aa  262  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  48.42 
 
 		 293 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  50.56 
 
 		 277 aa  259  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  49.82 
 
 		 310 aa  259  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  47.6 
 
 		 291 aa  254  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  46.57 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  46.93 
 
 		 283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  47.41 
 
 		 281 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  45.22 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  46.62 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  46.3 
 
 		 283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  48.12 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  47.21 
 
 		 279 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  46.57 
 
 		 293 aa  234  9e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  43.4 
 
 		 270 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  44.32 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  48.18 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  47.77 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  38.75 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  44.77 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  38.58 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 273 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  39.19 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  37.73 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  32.21 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  30.59 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  33.05 
 
 		 255 aa  89  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  34.64 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  39.57 
 
 		 299 aa  85.9  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 302 aa  85.5  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  44.95 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  38.13 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  38.13 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  38.13 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  37.32 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  37.32 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  37.32 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  36.29 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 		 241 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  41.28 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  43.12 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  33.59 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  43.52 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  46.43 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  38.82 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.37 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  36.31 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  38.83 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  46.51 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  44.19 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  37.86 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  32.8 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  40.48 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  38.32 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  34.26 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  35.29 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  40.48 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  35.29 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  38.27 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  37.63 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>