More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1415 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 300 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  99.33 
 
 		 300 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  70.14 
 
 		 319 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  68.28 
 
 		 293 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  68.62 
 
 		 293 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  68.28 
 
 		 293 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  65.17 
 
 		 293 aa  421  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  65.52 
 
 		 293 aa  411  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  67.59 
 
 		 291 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  65.17 
 
 		 294 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  65.52 
 
 		 293 aa  411  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  64.83 
 
 		 300 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  65.17 
 
 		 293 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  63.48 
 
 		 296 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  63.79 
 
 		 294 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  62.8 
 
 		 296 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  62.76 
 
 		 295 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  61.17 
 
 		 295 aa  377  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  57.68 
 
 		 378 aa  341  9e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  53.12 
 
 		 295 aa  330  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  43.06 
 
 		 299 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  39.27 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  39.5 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35.59 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  35.59 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  35.59 
 
 		 307 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  35.59 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  35.59 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  34.06 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  35.84 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 287 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  33.47 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  30.42 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  32.4 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  28.82 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  28.82 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  28.82 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.1 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  28.29 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 290 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  26.37 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  28.29 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 330 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 		 334 aa  89  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  25.51 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  23.89 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  26.14 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  24.7 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09327  conserved hypothetical protein  26.59 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  25.76 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  24.7 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  24.18 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  25.38 
 
 		 470 aa  76.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 341 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  26.36 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  27.76 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  25.95 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  25.56 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  25.47 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  27.8 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  27.65 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  23.97 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  24.81 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  24.81 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  24.81 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  24.81 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  24.81 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  24.81 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  27.44 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  27.44 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  27.44 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>