More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2033 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
300 aa  617  1e-176  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  83.79 
 
 
293 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  83.1 
 
 
293 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  78.62 
 
 
293 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  78.62 
 
 
294 aa  484  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  78.97 
 
 
293 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  78.97 
 
 
293 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  78.62 
 
 
293 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  75.17 
 
 
296 aa  472  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  77.24 
 
 
291 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  75.52 
 
 
293 aa  471  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  76.19 
 
 
294 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  74.48 
 
 
296 aa  464  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  74.58 
 
 
295 aa  458  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  71.18 
 
 
319 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  70.45 
 
 
295 aa  430  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  64.6 
 
 
300 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  64.6 
 
 
300 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  67.78 
 
 
378 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  57.09 
 
 
295 aa  351  8.999999999999999e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  48.23 
 
 
299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  38.87 
 
 
303 aa  226  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  38.01 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  38.01 
 
 
307 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  38.01 
 
 
307 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  38.01 
 
 
307 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  38.01 
 
 
307 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  36 
 
 
271 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  38.93 
 
 
279 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  37.28 
 
 
277 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  35.93 
 
 
299 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 
287 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  35.69 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 
264 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  32.25 
 
 
288 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  33.74 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.57 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
294 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 
273 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 
292 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  29.64 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  30.74 
 
 
302 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 
298 aa  112  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 
290 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 
282 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  26.95 
 
 
336 aa  99.8  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  32.01 
 
 
297 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  26.3 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  29.48 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  23.48 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  30.33 
 
 
317 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  28.02 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  28.4 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  28.46 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  26.8 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  28.52 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  36.84 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  25.31 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  24.07 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  28.69 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  29.51 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  27.05 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  24.07 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  27.89 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  23.39 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  28.68 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  30.2 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  28.68 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  24.28 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  27.54 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  28.68 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  24.69 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  28.68 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  26.4 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  28.68 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  26.46 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  29.51 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>