More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2100 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  52.3 
 
 		 292 aa  305  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  36.72 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  35.36 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 		 321 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  32.36 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  30.66 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  32.6 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  30.66 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  30.66 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.66 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  30.66 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  31.52 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  31.6 
 
 		 299 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  32.87 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  32.52 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  35.95 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 306 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  32.01 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.58 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  30.96 
 
 		 293 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  31.23 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.86 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  27.64 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  32.11 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.12 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  26.99 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  28.3 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 378 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  28.15 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 		 279 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  28.57 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  26.3 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  27.91 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.91 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  26.91 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  30.56 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  27.03 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  27.57 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  27.57 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  25.95 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  25.95 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  25.94 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  26.3 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  25.94 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  25.94 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  25.6 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  25.61 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  25.61 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  27 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  26.21 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  30.77 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  26.33 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  25.61 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  25.26 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  25.26 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  25.41 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  26.53 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  26.76 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  27.07 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  26.69 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  25.89 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  28.77 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  27.07 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  27.33 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>