203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6462 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 302 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  95.36 
 
 		 302 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  53.77 
 
 		 296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  52.41 
 
 		 294 aa  292  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  38.11 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  39.41 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  37.46 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  33.45 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  34.8 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  33.09 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  29.6 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.35 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  25.76 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  26.35 
 
 		 307 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  26.35 
 
 		 307 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  25.43 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  26.35 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 		 308 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  25.85 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  31.23 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.08 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  28.33 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 332 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  26.3 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  26.39 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  26.39 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  28 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  27.42 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  24.6 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  27.67 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  26.17 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  26.76 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  27.67 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  27.01 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  27.01 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  26.46 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  27.01 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  27.01 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  27.01 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  25.43 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  25.43 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  27.56 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  24.74 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  26.12 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  24.9 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  26.97 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  25.41 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  26.55 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  24.4 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  23.86 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  23.77 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  23.29 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  22.89 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  24.5 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  24.5 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  25.09 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  23.77 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  25.41 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2110  urate catabolism protein  23.75 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.822591  normal  0.031958 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  23.1 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0777  hypothetical protein  24.4 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  24.03 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03354  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B3VP82]  23.55 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  23.34 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  26.85 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1037  urate catabolism protein  22.95 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1117  polysaccharide deacetylase  23.47 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107227  normal  0.334948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  23.61 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  25.08 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>