More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3377 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  100 
 
 
307 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  99.02 
 
 
307 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  99.35 
 
 
307 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  99.02 
 
 
307 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  98.7 
 
 
307 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  48.16 
 
 
279 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  40 
 
 
293 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  39.72 
 
 
294 aa  215  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  40 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  41.06 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.23 
 
 
295 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  39.15 
 
 
291 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  40.43 
 
 
295 aa  209  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  41.73 
 
 
277 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  38.79 
 
 
293 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  38.79 
 
 
293 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  38.43 
 
 
293 aa  203  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  37.68 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  38.29 
 
 
287 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  40.15 
 
 
299 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  38.01 
 
 
300 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  36.91 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  40.96 
 
 
296 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  36.65 
 
 
293 aa  193  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 
296 aa  192  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
296 aa  192  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 
299 aa  189  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  35.59 
 
 
300 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 
300 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  37.82 
 
 
315 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  35.25 
 
 
321 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  35.14 
 
 
303 aa  172  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  36.71 
 
 
295 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
378 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 
264 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  35.25 
 
 
288 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 
289 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 
289 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 
289 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.81 
 
 
296 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  34.66 
 
 
299 aa  155  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 
294 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
295 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
295 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
295 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  33.45 
 
 
298 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  32.95 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 
282 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 
292 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 
290 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 
281 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 
336 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
306 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  30.66 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 
296 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  33.61 
 
 
308 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 
309 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  32.38 
 
 
308 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  31.97 
 
 
308 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  32.38 
 
 
308 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  31.56 
 
 
308 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  31.56 
 
 
309 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  31.15 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  32.08 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 
326 aa  93.2  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  29.55 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  30.74 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  28.98 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  29.29 
 
 
317 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  29.29 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  29.29 
 
 
317 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  27.81 
 
 
314 aa  87  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  29.29 
 
 
317 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  29.29 
 
 
317 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  22.97 
 
 
290 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  28.63 
 
 
301 aa  85.9  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  27.82 
 
 
296 aa  85.9  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
301 aa  85.9  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  27.91 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  26.86 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  28.33 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  28.33 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  27.12 
 
 
478 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
241 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  27.76 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2944  polysaccharide deacetylase  26.76 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000229991  decreased coverage  0.00000886209 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  25.31 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>