More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4982 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 292 aa  599  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  52.3 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 336 aa  212  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  39.58 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  41.42 
 
 		 295 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  41.42 
 
 		 295 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  41.42 
 
 		 295 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  39.78 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  38.15 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  41.35 
 
 		 264 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  38.43 
 
 		 321 aa  171  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  40.5 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  40.5 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  40.5 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  37.09 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  34.19 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  34.89 
 
 		 290 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.31 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  33.33 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  33.33 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  33.33 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  33.33 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  32.97 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  31.52 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  35.43 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  29.92 
 
 		 281 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  33.58 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  33.59 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  29.92 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  30.42 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  30.18 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  30.07 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  29.33 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  29.33 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  29.71 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 294 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  29.68 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  28.98 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  28.98 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 378 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.32 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  29.09 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.42 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  27.43 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  26.33 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03354  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B3VP82]  27.46 
 
 		 314 aa  85.5  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  27.09 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  26.16 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  26.16 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  24.83 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  27.74 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  27.72 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  28.39 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  25.49 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  27.59 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  27.12 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.83 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  25.85 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  27.08 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  26.58 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  27.16 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  26.51 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  26.62 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  26.58 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  27.39 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  25.58 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  26.3 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  27.39 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  27.06 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  27.78 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  26.05 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  26.58 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  26.58 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  26.21 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>