More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  100 
 
 		 295 aa  611  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  80.27 
 
 		 294 aa  511  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  74.66 
 
 		 293 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  76.71 
 
 		 293 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  74.06 
 
 		 295 aa  472  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  76.37 
 
 		 293 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  73.97 
 
 		 293 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  73.63 
 
 		 293 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  73.97 
 
 		 293 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  74.14 
 
 		 294 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  71.92 
 
 		 293 aa  457  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  75.52 
 
 		 300 aa  458  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  74.23 
 
 		 291 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  71.53 
 
 		 296 aa  454  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  71.48 
 
 		 296 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  69.66 
 
 		 319 aa  438  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  62.76 
 
 		 300 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  62.76 
 
 		 300 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  67.55 
 
 		 378 aa  381  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  58.13 
 
 		 295 aa  349  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  50.35 
 
 		 299 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  39.2 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  40.43 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  40.43 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  40.43 
 
 		 307 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  40.43 
 
 		 307 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  40.43 
 
 		 307 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  40.56 
 
 		 279 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  37.8 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  37.63 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  33.57 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  35.04 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  33.45 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  33.93 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.68 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  30.49 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  29.64 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 		 306 aa  96.3  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  30.08 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  29.69 
 
 		 308 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  30.74 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 		 336 aa  86.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  28.18 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  28.62 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  24.47 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  22.27 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  23.89 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  26 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  27.91 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  26.75 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  27.16 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  27.16 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  24.05 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  27.52 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  28.12 
 
 		 308 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 341 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  28.75 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  27.01 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  28.12 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000715916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  25.1 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  28.12 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.73 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  25.19 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  24.81 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  26.64 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  28.52 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  24.81 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  26.47 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  27.24 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  25.19 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>