231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1477 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 298 aa  623  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  38.21 
 
 		 290 aa  221  9e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  30.6 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  30.4 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  30.17 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  29.96 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  29.61 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  29.52 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 330 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  29.52 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  27.35 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  26.94 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  29.07 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  29.39 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 		 334 aa  99  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  28.76 
 
 		 475 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  26.61 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  30.4 
 
 		 478 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  28.89 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  26.79 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  26.79 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  29.52 
 
 		 478 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  26.52 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 336 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 341 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  26.86 
 
 		 320 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  27.27 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  25.51 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  25.1 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 336 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  24.29 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  29.82 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2733  polysaccharide deacetylase  25.75 
 
 		 337 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  30.57 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  27.31 
 
 		 482 aa  85.9  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  27.35 
 
 		 316 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  29.46 
 
 		 471 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  26.56 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  25.67 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  25.67 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2944  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000229991  decreased coverage  0.00000886209 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4489  chitin deacetylase  30.04 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785698 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  25.67 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  25.67 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  25.67 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  25.67 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  27.95 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  24.29 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.57 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  25.31 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  27.65 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  28.45 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  24.1 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.9 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0916  chitin deacetylase  28.57 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  27.14 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  24.29 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  24.29 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  29.6 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  29 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  28.19 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  27.64 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  24.9 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  31.14 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  24.9 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  24.9 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  26.99 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  30.84 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>