207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8430 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  38.54 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  38.38 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  37.94 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  37.33 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  38.18 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2733  polysaccharide deacetylase  36.03 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2944  polysaccharide deacetylase  39.01 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000229991  decreased coverage  0.00000886209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  36.43 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4850  polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3306  polysaccharide deacetylase  38.52 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5337  polysaccharide deacetylase  39.05 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1969  polysaccharide deacetylase  37.73 
 
 		 290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25912  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  32.53 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4566  polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5147  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.472101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0601  putative polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0399  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 470 aa  108  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  30.34 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  30.26 
 
 		 366 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3154  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0562684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 470 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  30.11 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  28.17 
 
 		 470 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  28.17 
 
 		 470 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  27.72 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  30.11 
 
 		 362 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  30.11 
 
 		 366 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  30.11 
 
 		 366 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  30.11 
 
 		 366 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5684  Chitin deacetylase  27.96 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260048  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  29.74 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  27.46 
 
 		 470 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  31.21 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  27.14 
 
 		 334 aa  99.8  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  26.76 
 
 		 471 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  29.03 
 
 		 364 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  26.37 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  30.87 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  27.89 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  26.83 
 
 		 471 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  27.62 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  27.55 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  27.87 
 
 		 482 aa  97.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09327  conserved hypothetical protein  32.64 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  27.55 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  26.35 
 
 		 309 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 471 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  27.97 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  25.56 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  27.02 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5844  urate catabolism protein  27.43 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  26.37 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.15 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  26.21 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4489  chitin deacetylase  27.72 
 
 		 309 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30682  predicted protein  27.65 
 
 		 339 aa  93.6  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673385  normal  0.0672265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  27.72 
 
 		 478 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  26.64 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  28.67 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0659  urate catabolism protein  26.99 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  27.53 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 		 334 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  25.28 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0916  chitin deacetylase  26.21 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  26.25 
 
 		 475 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  26.64 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0869  urate catabolism protein  26.64 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  27.46 
 
 		 478 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  27.61 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  27.46 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 		 314 aa  89.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  27.46 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  28.19 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  28.07 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>