207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5337 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5337  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4850  polysaccharide deacetylase  93.6 
 
 		 312 aa  568  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1969  polysaccharide deacetylase  95.29 
 
 		 290 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25912  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3306  polysaccharide deacetylase  83.39 
 
 		 296 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  59.58 
 
 		 313 aa  361  9e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  60 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  59.93 
 
 		 307 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0601  putative polysaccharide deacetylase  55.63 
 
 		 300 aa  340  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  58.33 
 
 		 313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5147  polysaccharide deacetylase  54.58 
 
 		 300 aa  332  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.472101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  56.31 
 
 		 321 aa  331  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  56.31 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  39.86 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2733  polysaccharide deacetylase  32.53 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  30.97 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4566  polysaccharide deacetylase  32.86 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  34.27 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2944  polysaccharide deacetylase  33.09 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000229991  decreased coverage  0.00000886209 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  32.5 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0399  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  30.77 
 
 		 305 aa  118  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 470 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5684  Chitin deacetylase  30.94 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260048  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4116  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 		 470 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  28.42 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3154  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0562684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  27.89 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  28.14 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0777  hypothetical protein  30.55 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  28.14 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  27.92 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.8 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  28.67 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  32.07 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  32.07 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  32.07 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  29.72 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  29.79 
 
 		 470 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  29.58 
 
 		 470 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  29.82 
 
 		 307 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0659  urate catabolism protein  28.32 
 
 		 319 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  26.41 
 
 		 293 aa  95.5  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 301 aa  95.9  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  29.08 
 
 		 470 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  27.7 
 
 		 482 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  29.23 
 
 		 478 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  29.35 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1058  polysaccharide deacetylase family protein  27.62 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  26.86 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  29.12 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1111  urate catabolism protein  27.62 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.808218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0869  urate catabolism protein  27.02 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  29.97 
 
 		 471 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  30.1 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  28.86 
 
 		 471 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  29.43 
 
 		 478 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 		 317 aa  92.4  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 471 aa  91.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  28.12 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  28.83 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 471 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  29.68 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  27.8 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  26.59 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  28.43 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 		 316 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  29.14 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  27.34 
 
 		 475 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3184  putative polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 		 327 aa  89  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0916  chitin deacetylase  25.61 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 471 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  29.14 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  29.14 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0901  urate catabolism protein  26.3 
 
 		 316 aa  86.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  27.76 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  28.81 
 
 		 317 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  24.31 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 		 359 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  26.28 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  26.62 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  27.87 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  28.15 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  28.15 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3533  chitin deacetylase 1  28.07 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0673867 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  28.15 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  28.31 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>