195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0601 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0601  putative polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 300 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5147  polysaccharide deacetylase  93.98 
 
 		 300 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.472101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  67.11 
 
 		 313 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  68.84 
 
 		 308 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  67.93 
 
 		 307 aa  421  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  65.33 
 
 		 321 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  63.09 
 
 		 321 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  61.09 
 
 		 313 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4850  polysaccharide deacetylase  55.63 
 
 		 312 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1969  polysaccharide deacetylase  56.46 
 
 		 290 aa  332  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25912  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5337  polysaccharide deacetylase  55.6 
 
 		 297 aa  332  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3306  polysaccharide deacetylase  56.14 
 
 		 296 aa  315  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2733  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 337 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0399  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4566  polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2944  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 295 aa  125  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000229991  decreased coverage  0.00000886209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  29.45 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  29.23 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3154  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0562684 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  27.92 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4116  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 303 aa  99  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 336 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  27.63 
 
 		 366 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  28.07 
 
 		 362 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  28.07 
 
 		 366 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  28.07 
 
 		 366 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  28.07 
 
 		 366 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  28.07 
 
 		 362 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 298 aa  95.5  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  27.33 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  27.21 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5684  Chitin deacetylase  27.04 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260048  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  27.82 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  27.37 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0777  hypothetical protein  27.09 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3184  putative polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 		 326 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  24.6 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  28.28 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  23.84 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  28.06 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  27.93 
 
 		 470 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  24.31 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  28.72 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  24.31 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  24.31 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  26.76 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  24.7 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  27.59 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  23.76 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  27.54 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  27.59 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  26.83 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 		 471 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  24.2 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  26.89 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  27.72 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  24.7 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  26.48 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4321  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  25.9 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  28.57 
 
 		 482 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  28.01 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  28.01 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  28.01 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  23.7 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  25.57 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  28.47 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  26.56 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  27.39 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  26.89 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  26.89 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  27.67 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  24.92 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  26.52 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  26.89 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  26.89 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  26.89 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  26.23 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>