178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3154 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3154  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 294 aa  584  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0562684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2944  polysaccharide deacetylase  37.46 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000229991  decreased coverage  0.00000886209 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  39.44 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4566  polysaccharide deacetylase  34.63 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0399  polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  30.77 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1969  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25912  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  30.23 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5337  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0601  putative polysaccharide deacetylase  28.3 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5147  polysaccharide deacetylase  27.99 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.472101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  27.99 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4850  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2733  polysaccharide deacetylase  23.78 
 
 		 337 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3306  polysaccharide deacetylase  32.78 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  28.4 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  29.6 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  28.16 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  29.72 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4116  polysaccharide deacetylase  25.69 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  23.66 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  26.67 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  23.3 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  23.33 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  25.31 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  25.53 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  27.27 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  24.9 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  26.36 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  26.74 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  27.59 
 
 		 470 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  26.36 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  26.36 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0777  hypothetical protein  24.91 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  29.75 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  25.84 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  29.35 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  26.54 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  31.58 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  28.12 
 
 		 475 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  27.14 
 
 		 482 aa  69.3  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5684  Chitin deacetylase  24.65 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260048  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0916  chitin deacetylase  25.17 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 470 aa  69.3  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  27.65 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  26.59 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  28.52 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  28 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1058  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  27.9 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1163  chitin deacetylase  26.39 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.425036  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  23.97 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  24.42 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  25.1 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  29.95 
 
 		 475 aa  66.2  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  29.95 
 
 		 475 aa  66.2  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4268  chitin deacetylase  30.56 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  22.02 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4321  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 		 471 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09327  conserved hypothetical protein  24.34 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  24.14 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1111  urate catabolism protein  24.66 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.808218  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3533  chitin deacetylase 1  25.1 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0673867 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  24.46 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  23.99 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  26.35 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  23.62 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  23.62 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  25.19 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  23.62 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  23.62 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  23.62 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  27.4 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  24.45 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  22.02 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  27.88 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>