More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0456 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  98.48 
 
 		 330 aa  677    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 330 aa  687    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  83.83 
 
 		 334 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  83.23 
 
 		 334 aa  585  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  54.04 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  54.04 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  51.44 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  51.08 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  50.72 
 
 		 336 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  50.35 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  50.72 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  50.72 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  51.1 
 
 		 366 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  51.1 
 
 		 362 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  51.1 
 
 		 366 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  51.1 
 
 		 366 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  51.1 
 
 		 362 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  51.28 
 
 		 364 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  51.48 
 
 		 366 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  33.7 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  34.89 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  34.05 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  34.05 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  34.05 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  33.69 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  33.09 
 
 		 309 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  34.05 
 
 		 308 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  32.73 
 
 		 308 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  31.18 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  33.21 
 
 		 296 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  32.97 
 
 		 478 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  33.21 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  32.62 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  31.73 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  32.38 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  32.14 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  31.67 
 
 		 316 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  31.99 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30682  predicted protein  30.56 
 
 		 339 aa  136  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673385  normal  0.0672265 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  32.74 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  32.74 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  32.74 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  32.74 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  32.38 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  32.74 
 
 		 317 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  30.85 
 
 		 318 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  32.5 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  29.86 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  32.38 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  32.38 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  31.54 
 
 		 470 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  32 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  32.25 
 
 		 478 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  31.08 
 
 		 470 aa  133  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  31.88 
 
 		 471 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  31.18 
 
 		 470 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  32.16 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  31.64 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  30.63 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  28.57 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 		 471 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  31.8 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  32.17 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  30.8 
 
 		 471 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5844  urate catabolism protein  30.96 
 
 		 387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 		 312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  31.07 
 
 		 475 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  30.87 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  31.45 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  31.45 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  31.1 
 
 		 314 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  30.36 
 
 		 482 aa  126  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 470 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4321  polysaccharide deacetylase  29.18 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  30 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09327  conserved hypothetical protein  29.18 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  30.33 
 
 		 471 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  30.71 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  29.75 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 471 aa  119  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  31.32 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  28.27 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0777  hypothetical protein  29.54 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  29.14 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1163  chitin deacetylase  29.29 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.425036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>