201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0399 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0399  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 301 aa  600  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4566  polysaccharide deacetylase  77.03 
 
 		 304 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2944  polysaccharide deacetylase  54.23 
 
 		 295 aa  305  6e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000229991  decreased coverage  0.00000886209 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  45.49 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3154  polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0562684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 298 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  35.47 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  34.89 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  34.17 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4850  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  32.53 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5337  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5147  polysaccharide deacetylase  34.64 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.472101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0601  putative polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1969  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25912  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3306  polysaccharide deacetylase  36.47 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  32.48 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2733  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3184  putative polysaccharide deacetylase  32.73 
 
 		 327 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  27.39 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  28.83 
 
 		 470 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  28.83 
 
 		 470 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  28.62 
 
 		 470 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0901  urate catabolism protein  27.97 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0869  urate catabolism protein  27.24 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  28.68 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5844  urate catabolism protein  28.21 
 
 		 387 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 312 aa  85.9  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  28.03 
 
 		 323 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  28.01 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  29.77 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  28.57 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  26.77 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1163  chitin deacetylase  29.23 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.425036  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1111  urate catabolism protein  25.09 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.808218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  29.05 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1058  polysaccharide deacetylase family protein  25.09 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  29.45 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  28.47 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  28.62 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  28.81 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0777  hypothetical protein  27.36 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0916  chitin deacetylase  25 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  25.69 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  28.52 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  25.69 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  29.14 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  29.14 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  27.14 
 
 		 475 aa  79.7  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 471 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  28.99 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4116  polysaccharide deacetylase  26.84 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  27.91 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  24.73 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4489  chitin deacetylase  26.98 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  25.18 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  26.43 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  26.43 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  26.35 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  27.27 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  29.03 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  27.91 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  27.91 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  27.91 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  30.9 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  27.91 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  27.91 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  27.91 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3533  chitin deacetylase 1  24.89 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0673867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  27.53 
 
 		 322 aa  75.5  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  25.18 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  25.18 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  26.67 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  26.47 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  25.97 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  27.57 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  24.82 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>