197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5147 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5147  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 300 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.472101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0601  putative polysaccharide deacetylase  93.98 
 
 		 300 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  68.37 
 
 		 313 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  67.59 
 
 		 307 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  67.81 
 
 		 308 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  64.9 
 
 		 321 aa  407  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  62.67 
 
 		 321 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  61.09 
 
 		 313 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4850  polysaccharide deacetylase  56.34 
 
 		 312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1969  polysaccharide deacetylase  55.72 
 
 		 290 aa  328  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25912  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5337  polysaccharide deacetylase  55.39 
 
 		 297 aa  325  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3306  polysaccharide deacetylase  56.14 
 
 		 296 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2733  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 		 337 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0399  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4566  polysaccharide deacetylase  33.69 
 
 		 304 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  32.95 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2944  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000229991  decreased coverage  0.00000886209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  28.77 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  29.67 
 
 		 336 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 336 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  29.04 
 
 		 364 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3154  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0562684 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  28.86 
 
 		 362 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  27.95 
 
 		 362 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  28.86 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  28.86 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  28.86 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  27.95 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4116  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  25.57 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  27.02 
 
 		 336 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  28.19 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5684  Chitin deacetylase  27.88 
 
 		 302 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260048  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  28.28 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  25.7 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0777  hypothetical protein  27.68 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  27.07 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  28.42 
 
 		 470 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  28.22 
 
 		 310 aa  85.5  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  27.37 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3184  putative polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  27.56 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  27.92 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  27.86 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  23.66 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  24.7 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  27.37 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  24.23 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  26.6 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  25.85 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  23.55 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4321  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  23.55 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  23.55 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  28.07 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  26.95 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  28.62 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  26.64 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  28.9 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  27.78 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  23.97 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5844  urate catabolism protein  27.72 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  27.37 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  27.53 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  27.05 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1037  urate catabolism protein  29.53 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  28.03 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  27.46 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  29.25 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  29.25 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  29.25 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  27.8 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  26.48 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>