209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2733 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2733  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 337 aa  715    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  36.03 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4850  polysaccharide deacetylase  33.56 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5147  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 		 300 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.472101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5337  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  32.19 
 
 		 307 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  30.74 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1969  polysaccharide deacetylase  32.27 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25912  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  32.3 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0601  putative polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 		 321 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  31.88 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3306  polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2944  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 		 295 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000229991  decreased coverage  0.00000886209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4566  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0399  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  26.19 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  28.87 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4489  chitin deacetylase  29.32 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  27.65 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  28.48 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  27.6 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  30.96 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 336 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 309 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  28.91 
 
 		 482 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  26.27 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.65 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 330 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 471 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4116  polysaccharide deacetylase  26.99 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  29.63 
 
 		 475 aa  96.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  27.3 
 
 		 308 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  29.71 
 
 		 307 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  27.65 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 470 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  28.26 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  27.3 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  26.46 
 
 		 470 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  29.22 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  27.12 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09327  conserved hypothetical protein  27.94 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  27.99 
 
 		 475 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 295 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 471 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  26.46 
 
 		 470 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  26.46 
 
 		 470 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  28.38 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  28.08 
 
 		 323 aa  92.4  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  26.89 
 
 		 308 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  27.7 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  25.56 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  28.81 
 
 		 471 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3154  polysaccharide deacetylase  23.97 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0562684 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  27.24 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5844  urate catabolism protein  28.04 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  29.67 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  26.89 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  29.29 
 
 		 478 aa  89  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  29.39 
 
 		 471 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1058  polysaccharide deacetylase family protein  25.75 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  27.33 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  27.12 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1111  urate catabolism protein  25.75 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.808218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  28.93 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  27.16 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  26.21 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  26.95 
 
 		 471 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  26.91 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  26.47 
 
 		 320 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  28.93 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  28.93 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  28.93 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  28.1 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3533  chitin deacetylase 1  27.69 
 
 		 255 aa  87.8  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0673867 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  25.68 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 470 aa  86.7  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 332 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  28.93 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  28.93 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  28.1 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  28.93 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  29.57 
 
 		 296 aa  85.9  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 317 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>