More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3662 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 378 aa  770    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  76.03 
 
 		 296 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  73.06 
 
 		 296 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  69.06 
 
 		 293 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  68.68 
 
 		 293 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  67.29 
 
 		 294 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  67.17 
 
 		 291 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  68.68 
 
 		 300 aa  396  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  66.04 
 
 		 293 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  67.29 
 
 		 294 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  67.55 
 
 		 295 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  64.91 
 
 		 293 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  64.53 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  64.53 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  64.53 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  64.53 
 
 		 319 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  61.28 
 
 		 295 aa  355  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  58.05 
 
 		 300 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  57.68 
 
 		 300 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  51.1 
 
 		 295 aa  299  6e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  41.15 
 
 		 299 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  40.28 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  36.43 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  34.38 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  34.38 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  34.38 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  34.38 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  34.38 
 
 		 307 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 		 287 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 271 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 321 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  32.51 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  30.82 
 
 		 288 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  33.07 
 
 		 289 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  33.07 
 
 		 289 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  33.07 
 
 		 289 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.63 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 273 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 295 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 295 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  30.68 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  26.44 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 290 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 		 263 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  25.95 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 302 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 298 aa  93.2  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  24.19 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  24.1 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  30.2 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  29.69 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  26.48 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  26.48 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  26.94 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  29.69 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  23.61 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2094  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  30.08 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  28.52 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  24.18 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  27.16 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  25.63 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  29.57 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  24.18 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  26.45 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  25.3 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  24.24 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  25.64 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  26.34 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  26.34 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  26.34 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  26.34 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  39.81 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  26.34 
 
 		 362 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  29.02 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  28.68 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  26.69 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  29.02 
 
 		 317 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>