More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0203 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 292 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2094  polysaccharide deacetylase  47.92 
 
 		 284 aa  218  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  34.06 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 306 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  33.57 
 
 		 282 aa  99.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 		 281 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  30.18 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  31.36 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  31.36 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  31.36 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.31 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.27 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  27.27 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  27.27 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  27.27 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  44.14 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  26.86 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  42.99 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  26.78 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  31.42 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  41.51 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  43.52 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  33.33 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  32.82 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  44.86 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 430 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  42.59 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  38.14 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  34.26 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  37.84 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  41.67 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  34.71 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  27.22 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  42.45 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  32.35 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  34.71 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  36.89 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  34.71 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  36.89 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  46.59 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  42.98 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  32 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  34.11 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  38.39 
 
 		 277 aa  67  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  41.57 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  32 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  24.6 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.62 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  32.67 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  43.18 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  35.58 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  40.74 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 		 372 aa  65.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  31.37 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  36.63 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  41.03 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  42.99 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  40.23 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  37.36 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  42.27 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  41.51 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>