More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2673 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
413 aa  831    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  62.44 
 
 
430 aa  486  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  53.54 
 
 
404 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  52.86 
 
 
409 aa  355  8.999999999999999e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 
387 aa  130  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.51 
 
 
251 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  37.63 
 
 
258 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 
320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  34.59 
 
 
247 aa  126  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  42.38 
 
 
227 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  37.04 
 
 
241 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  34.9 
 
 
299 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  41.44 
 
 
267 aa  123  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  32.62 
 
 
259 aa  123  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 
264 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 
221 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 
213 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 
220 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  34.68 
 
 
256 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.6 
 
 
373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 
305 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
372 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  34.97 
 
 
417 aa  119  7e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
213 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
213 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
213 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
241 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
204 aa  119  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  26.52 
 
 
244 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 
242 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 
258 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.22 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
241 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 
199 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  31.41 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  34.39 
 
 
241 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 
258 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  37.19 
 
 
1120 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 
302 aa  117  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  37.56 
 
 
259 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  35.89 
 
 
250 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
238 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  36.09 
 
 
320 aa  116  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 
264 aa  116  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  30.37 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
217 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36.99 
 
 
321 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  36 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  30.54 
 
 
279 aa  114  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  34.22 
 
 
244 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  37.35 
 
 
240 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 
289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  33.88 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  31.32 
 
 
258 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 
284 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  31.41 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
1124 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 
247 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 
299 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 
299 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 
299 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 
299 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.24 
 
 
405 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 
299 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 
299 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.87 
 
 
250 aa  109  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 
321 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 
299 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  32.82 
 
 
263 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32.6 
 
 
275 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 
299 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  31.41 
 
 
299 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  29.83 
 
 
261 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  37.13 
 
 
243 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 
276 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
241 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
251 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 
294 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 
272 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  38.56 
 
 
267 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  31.02 
 
 
275 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 
295 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  34.78 
 
 
468 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 
275 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 
275 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 
275 aa  106  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 
413 aa  106  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 
275 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 
275 aa  106  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 
291 aa  106  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
286 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
1115 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  33.33 
 
 
1115 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  33.33 
 
 
1119 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  40.36 
 
 
242 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 
255 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  32.6 
 
 
258 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>