More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1086 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
261 aa  531  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  41.83 
 
 
258 aa  216  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  43.78 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  41.15 
 
 
259 aa  194  9e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  39.44 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 
256 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  37 
 
 
291 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  36.79 
 
 
417 aa  142  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  35.8 
 
 
256 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  38.58 
 
 
321 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 
387 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 
255 aa  131  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  36.1 
 
 
277 aa  131  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.73 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 
221 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.87 
 
 
405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 
224 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
305 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 
404 aa  125  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  38.12 
 
 
287 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  31.02 
 
 
287 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
244 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 
324 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  36.49 
 
 
234 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  37.24 
 
 
372 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 
264 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
212 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  36.49 
 
 
234 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  35.39 
 
 
246 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  34.59 
 
 
327 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 
273 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 
204 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
287 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 
465 aa  121  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  29.47 
 
 
468 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  40.64 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  35.33 
 
 
373 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 
537 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  33.51 
 
 
349 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  38.12 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  29.69 
 
 
283 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  32.48 
 
 
479 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.42 
 
 
250 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 
247 aa  119  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  36.04 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 
392 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  32.76 
 
 
479 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  34.63 
 
 
409 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 
503 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  32.22 
 
 
279 aa  119  7e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  30.7 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  35.2 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 
397 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  30.87 
 
 
481 aa  116  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  34.69 
 
 
273 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  35.08 
 
 
244 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 
275 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 
413 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 
522 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
372 aa  115  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 
217 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  32.76 
 
 
321 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  35.43 
 
 
234 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  35.57 
 
 
220 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  31.67 
 
 
260 aa  115  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  35.32 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  29 
 
 
317 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 
275 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 
275 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  32.5 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 
430 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.04 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  32.58 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.05 
 
 
241 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>