More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02423 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  100 
 
 		 260 aa  520  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  60.23 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  60.23 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  57.92 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  45.77 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  42.04 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  41.78 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  43.43 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  43.43 
 
 		 280 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  39.21 
 
 		 285 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  40.58 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  41.28 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  40.09 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  40.93 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  40.09 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  39.7 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  38.77 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  38.71 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  39.79 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  38.07 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  35.75 
 
 		 349 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  35.4 
 
 		 270 aa  122  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  38.92 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  42.17 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  36.47 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.67 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  32.02 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  32.08 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  36.68 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  34.25 
 
 		 481 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  35.43 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  40.96 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  36.05 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  37.84 
 
 		 353 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.33 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  42.31 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  28.92 
 
 		 234 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  35.61 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  28.43 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 372 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  37.43 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  30.09 
 
 		 417 aa  99.8  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  28.29 
 
 		 234 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  37.43 
 
 		 468 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  28.43 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  39.46 
 
 		 227 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 		 217 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 		 300 aa  99  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  39.89 
 
 		 259 aa  98.6  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 		 299 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.08 
 
 		 387 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  33.33 
 
 		 479 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 479 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.93 
 
 		 305 aa  95.9  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 		 235 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  34.45 
 
 		 241 aa  95.9  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.1 
 
 		 405 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  35.53 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 		 320 aa  93.2  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 		 234 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 252 aa  92.8  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 		 321 aa  92.8  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  30.72 
 
 		 221 aa  92  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  36.16 
 
 		 404 aa  92  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  26.83 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  31.25 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  28.02 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 392 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  40.34 
 
 		 352 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  24.87 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  28.16 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  37.22 
 
 		 413 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 465 aa  87.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 1124 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 409 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  32.95 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  35.39 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 542 aa  86.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 		 372 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>