More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3369 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  57.66 
 
 		 275 aa  289  3e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  57.26 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  56.37 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  45.96 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  46.53 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  42.24 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  38.43 
 
 		 266 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  41.02 
 
 		 284 aa  148  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  42.2 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  38.67 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  45.41 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  39.82 
 
 		 287 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  43.43 
 
 		 294 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  39.73 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  40.17 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  41.56 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  43.92 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  40.61 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  33 
 
 		 258 aa  135  7.000000000000001e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  40.18 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  37.93 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  32.95 
 
 		 349 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  42.17 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  32.16 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  41.46 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  42.07 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  33.91 
 
 		 481 aa  105  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  37.78 
 
 		 267 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  38.2 
 
 		 404 aa  102  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  37.71 
 
 		 468 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 		 221 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  27.94 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  28.49 
 
 		 279 aa  95.1  9e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  37.22 
 
 		 430 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 324 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 		 317 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  32.95 
 
 		 413 aa  92.8  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 372 aa  91.3  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.42 
 
 		 373 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 		 204 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 387 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  25.49 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  29.94 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 240 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  31.46 
 
 		 479 aa  90.1  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  23.94 
 
 		 300 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 		 199 aa  89.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  32.57 
 
 		 479 aa  89.4  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  29.67 
 
 		 211 aa  89  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  32.57 
 
 		 537 aa  89  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 		 353 aa  88.6  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 405 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  35.09 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.23 
 
 		 321 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  26.9 
 
 		 234 aa  85.9  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 275 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  26.7 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 275 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 275 aa  85.5  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  35.36 
 
 		 244 aa  85.5  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 275 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  26.9 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  26.48 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  31.15 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  28.41 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  34.1 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  29.93 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  37.58 
 
 		 542 aa  84  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.1 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  27.08 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>