More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0920 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 270 aa  537  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  58.78 
 
 		 267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  55.38 
 
 		 266 aa  268  7e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  54.79 
 
 		 284 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  56.32 
 
 		 272 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  56.15 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  59.77 
 
 		 300 aa  260  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  57.98 
 
 		 280 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  53.93 
 
 		 287 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  53.56 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  53.96 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  52.73 
 
 		 286 aa  251  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  53.18 
 
 		 294 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  53.18 
 
 		 294 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  51.7 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  52.81 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  52.76 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  56.07 
 
 		 287 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  53.66 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  46.52 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  50.22 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  46.35 
 
 		 349 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  36.1 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  37.45 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  34.76 
 
 		 275 aa  136  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  36.09 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  33.86 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  36.1 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  39.53 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.28 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  38.83 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  41.48 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 479 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  31.78 
 
 		 479 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  36.23 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 425 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  37.66 
 
 		 373 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  32.78 
 
 		 258 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  39.53 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  30.23 
 
 		 481 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 		 404 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 		 368 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 		 413 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 		 247 aa  99  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 243 aa  98.6  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  29.38 
 
 		 417 aa  98.2  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.89 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  42.58 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 752 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 		 244 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  28.99 
 
 		 235 aa  95.9  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 1120 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 		 213 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  30.16 
 
 		 244 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  31.79 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  37.57 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  28.72 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 		 213 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  33.83 
 
 		 204 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 		 213 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 413 aa  94  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 		 213 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  33.14 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 240 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 		 217 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 219 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 252 aa  92.8  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 217 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 		 218 aa  92  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  32.45 
 
 		 244 aa  92  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  31.92 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.91 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  30.72 
 
 		 344 aa  89.4  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 430 aa  89.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  32.5 
 
 		 229 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 372 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 300 aa  89  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 252 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 201 aa  89  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 		 387 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 		 353 aa  89  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1347  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 		 196 aa  89  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0921833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  26.97 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>