More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01375 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 218 aa  453  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  50.48 
 
 		 212 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0661  polysaccharide deacetylase  47.25 
 
 		 205 aa  211  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5477  polysaccharide deacetylase  43.52 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2237  polysaccharide deacetylase  41.9 
 
 		 215 aa  184  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  42.23 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0244  polysaccharide deacetylase  43.87 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  41.67 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.82 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.19 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 305 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  32.84 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 277 aa  114  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 		 321 aa  112  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  33 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  34.85 
 
 		 261 aa  111  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 405 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  33.16 
 
 		 259 aa  108  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.27 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 		 425 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 286 aa  104  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 		 522 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  38.51 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  35.8 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  37.89 
 
 		 275 aa  101  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 465 aa  101  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 		 275 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  37.89 
 
 		 275 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 256 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  36.65 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 		 413 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 409 aa  99.8  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 		 275 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 		 267 aa  99  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 430 aa  99  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  29.32 
 
 		 468 aa  99  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 267 aa  99  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 		 256 aa  99  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  34.08 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  30.14 
 
 		 285 aa  98.2  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  34.08 
 
 		 349 aa  98.2  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 368 aa  98.2  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 263 aa  98.2  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 251 aa  98.2  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 		 299 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 		 238 aa  97.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 		 289 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 		 287 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 		 294 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 240 aa  96.7  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 404 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 286 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  30.37 
 
 		 488 aa  96.3  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 		 241 aa  96.3  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  32.86 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.16 
 
 		 279 aa  94.4  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  34.3 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 372 aa  94.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 300 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 		 300 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 		 244 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 413 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 273 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  29.94 
 
 		 301 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  32.18 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 273 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 273 aa  92.8  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 273 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>