More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4749 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
240 aa  501  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  39.32 
 
 
251 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  37.88 
 
 
305 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 
321 aa  142  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  34.32 
 
 
479 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 
302 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  38.54 
 
 
320 aa  137  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
405 aa  136  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  38.66 
 
 
277 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 
503 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  35.42 
 
 
417 aa  131  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  32.63 
 
 
481 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  36.68 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  37.19 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  37.19 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  37.19 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  37.19 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  36.95 
 
 
413 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  36.68 
 
 
213 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  36.68 
 
 
241 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.19 
 
 
264 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  38.86 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.29 
 
 
468 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
479 aa  128  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
275 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  35.68 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  36.18 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 
247 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  33.93 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
275 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
275 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 
229 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 
276 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  35.12 
 
 
275 aa  124  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 
280 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 
324 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  33.85 
 
 
373 aa  123  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 
273 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  30.57 
 
 
279 aa  122  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  32.12 
 
 
258 aa  123  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 
292 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
221 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  34.19 
 
 
246 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.29 
 
 
373 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 
283 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  34.19 
 
 
349 aa  122  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
204 aa  121  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  33.05 
 
 
1119 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  37.56 
 
 
1101 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  34.45 
 
 
927 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  34.45 
 
 
1115 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
317 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 
263 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.45 
 
 
1115 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.97 
 
 
1115 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.66 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  34.56 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  34.67 
 
 
1099 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 
212 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  34.67 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  34 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  32.86 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 
372 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  35.29 
 
 
573 aa  116  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 
216 aa  116  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.45 
 
 
1115 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  38.12 
 
 
1124 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36.67 
 
 
321 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
267 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 
353 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
537 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  34.8 
 
 
364 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  33.49 
 
 
872 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  34.34 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  36.13 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  40.79 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  33.14 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  33.02 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 
387 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>