More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1500 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
320 aa  648    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  45.5 
 
 
258 aa  182  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  41.58 
 
 
251 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  43.41 
 
 
417 aa  168  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  42.08 
 
 
387 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  40.58 
 
 
244 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  37.61 
 
 
373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  46.28 
 
 
413 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  45.65 
 
 
468 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  38.83 
 
 
465 aa  158  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  44.28 
 
 
503 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  40.34 
 
 
287 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  42.71 
 
 
220 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  40.4 
 
 
250 aa  156  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  41.95 
 
 
277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 
302 aa  155  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  42.71 
 
 
241 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  44.04 
 
 
267 aa  155  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  45.21 
 
 
273 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  35.77 
 
 
321 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  41.15 
 
 
213 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  41.15 
 
 
213 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  41.67 
 
 
241 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  41.15 
 
 
213 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  41.15 
 
 
241 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  42.16 
 
 
522 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  41.15 
 
 
213 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  46.29 
 
 
227 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  40.1 
 
 
537 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  38.54 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  43.32 
 
 
307 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  40.86 
 
 
404 aa  145  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  38.12 
 
 
251 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  40.1 
 
 
244 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
275 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  39.58 
 
 
217 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  43.32 
 
 
291 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  38.22 
 
 
275 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  40.64 
 
 
247 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  38.74 
 
 
276 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
275 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 
247 aa  142  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  36.98 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
275 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  40.86 
 
 
229 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 
204 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  39.09 
 
 
324 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  39.33 
 
 
542 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
275 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 
405 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 
291 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 
264 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  37 
 
 
488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 
244 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.98 
 
 
372 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  42.78 
 
 
247 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 
248 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  38.54 
 
 
240 aa  136  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  36.96 
 
 
264 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 
1115 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  36.36 
 
 
1115 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  36.36 
 
 
1119 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.89 
 
 
1115 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 
246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  39 
 
 
262 aa  133  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.89 
 
 
1115 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
221 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  35.81 
 
 
273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 
255 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  38.81 
 
 
373 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  35.81 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  35.81 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  35.81 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  35.81 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  35.81 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  35.81 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  36.24 
 
 
273 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 
299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  36.36 
 
 
927 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 
285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
430 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  40.93 
 
 
275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  40.93 
 
 
275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  40.93 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  36.46 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 
413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  40.93 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  40.93 
 
 
275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  40.93 
 
 
275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  36.9 
 
 
294 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  35.26 
 
 
440 aa  127  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
344 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>