More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1621 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  100 
 
 		 488 aa  991    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  40.88 
 
 		 522 aa  322  7e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  34.03 
 
 		 468 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  40.07 
 
 		 503 aa  200  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  32.7 
 
 		 537 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  41.98 
 
 		 267 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  44.29 
 
 		 273 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  43.78 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  45.77 
 
 		 287 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  42.39 
 
 		 417 aa  160  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  45.73 
 
 		 387 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  41.05 
 
 		 465 aa  156  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 		 291 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  41.12 
 
 		 373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  33.23 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  38.92 
 
 		 373 aa  145  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  39.6 
 
 		 247 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 		 258 aa  143  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  32.5 
 
 		 292 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37.69 
 
 		 251 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  38.35 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 		 248 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  38.12 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  39.61 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 		 258 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  40.22 
 
 		 279 aa  134  5e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  36.24 
 
 		 542 aa  134  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  40.98 
 
 		 242 aa  134  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 		 317 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  37.63 
 
 		 255 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 256 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.47 
 
 		 440 aa  126  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  36.26 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  42.61 
 
 		 227 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 		 247 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 		 345 aa  123  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 		 321 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 199 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  36.98 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  33.67 
 
 		 244 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37.63 
 
 		 250 aa  117  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 		 251 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 		 275 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 		 264 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.38 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 204 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 		 276 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 		 299 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 		 204 aa  114  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  34.27 
 
 		 239 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 		 275 aa  113  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  33.87 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  33.76 
 
 		 683 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  32.66 
 
 		 327 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  39.53 
 
 		 692 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 239 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 248 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  33.69 
 
 		 247 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 		 275 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 1124 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  33.89 
 
 		 262 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 		 250 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  29.3 
 
 		 261 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  31.55 
 
 		 234 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 		 302 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 277 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  29.69 
 
 		 258 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 234 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  37.57 
 
 		 229 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 		 261 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 522 aa  106  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 234 aa  106  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 308 aa  106  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 382 aa  106  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  33.5 
 
 		 237 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 273 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 234 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 234 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 234 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 234 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  33.17 
 
 		 1099 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2237  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 		 215 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.85 
 
 		 1115 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  33.85 
 
 		 1115 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.85 
 
 		 1115 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 234 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>