More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2237 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2237  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 215 aa  451  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5477  polysaccharide deacetylase  56.59 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0661  polysaccharide deacetylase  54.41 
 
 		 205 aa  230  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  43.81 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0244  polysaccharide deacetylase  46.41 
 
 		 208 aa  201  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  40.27 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  41.21 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  41.9 
 
 		 218 aa  184  9e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 277 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  32.97 
 
 		 488 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  35.71 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.47 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 		 276 aa  101  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 		 275 aa  101  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 		 275 aa  101  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 		 275 aa  101  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 275 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.42 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 261 aa  99.4  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  31.66 
 
 		 479 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 302 aa  98.6  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.88 
 
 		 417 aa  98.2  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  34.42 
 
 		 275 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 321 aa  98.2  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.16 
 
 		 241 aa  97.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 		 430 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  33.16 
 
 		 349 aa  95.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 368 aa  94.7  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 503 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  29.76 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  29.77 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 413 aa  94  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 		 267 aa  92  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  28.35 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 		 425 aa  91.7  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  32.43 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  33.87 
 
 		 468 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 465 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.11 
 
 		 373 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 522 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  29.32 
 
 		 479 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 465 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  28.5 
 
 		 481 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 258 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 405 aa  89.4  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  31.55 
 
 		 244 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  28.78 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 		 258 aa  88.6  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  33.73 
 
 		 287 aa  88.2  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 		 251 aa  88.2  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 372 aa  88.2  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 372 aa  88.2  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  28.25 
 
 		 289 aa  87.8  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  26.67 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 357 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 542 aa  86.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 409 aa  86.7  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  29.95 
 
 		 259 aa  86.3  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  34.05 
 
 		 522 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  29.78 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 294 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 		 256 aa  85.5  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 871 aa  85.1  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 387 aa  84.7  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  28.72 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  33.14 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  28.87 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  26.29 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  30.81 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>