More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2798 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
321 aa  649    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  49.55 
 
 
305 aa  242  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  54.79 
 
 
277 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  50.22 
 
 
302 aa  239  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  44.66 
 
 
251 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
264 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  37.57 
 
 
413 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 
244 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  38.05 
 
 
320 aa  153  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  43.48 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  40.09 
 
 
373 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  38.31 
 
 
522 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  39.36 
 
 
503 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  39.58 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  43.48 
 
 
1115 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  43.48 
 
 
1119 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  41.27 
 
 
372 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  41.24 
 
 
221 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  43.48 
 
 
1115 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  36.87 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  43 
 
 
872 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  43.48 
 
 
927 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  41.7 
 
 
1115 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  43 
 
 
1115 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
317 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  38 
 
 
368 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  41.33 
 
 
220 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  40.21 
 
 
387 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  41.84 
 
 
213 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  41.84 
 
 
241 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  41.84 
 
 
213 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  41.84 
 
 
213 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  41.84 
 
 
213 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  40.82 
 
 
241 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 
240 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  42.27 
 
 
275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  42.56 
 
 
275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
247 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  35.34 
 
 
373 aa  140  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.24 
 
 
440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  42.56 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  42.05 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  42.05 
 
 
276 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  42.27 
 
 
275 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  42.27 
 
 
275 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  42.05 
 
 
275 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  42.27 
 
 
275 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  39.8 
 
 
241 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  37.56 
 
 
244 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  40.72 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  38.58 
 
 
261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  38.95 
 
 
537 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  35.57 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  39.29 
 
 
241 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
273 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  39.8 
 
 
244 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 
217 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 
229 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  41.54 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  38.02 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  36.84 
 
 
1099 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  34.85 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  38.62 
 
 
468 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 
522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  38.89 
 
 
573 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 
295 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
251 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 
267 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  36.81 
 
 
283 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  37.89 
 
 
263 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  40.51 
 
 
250 aa  129  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 
353 aa  129  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 
247 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  37.17 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  38.19 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 
255 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  36.63 
 
 
465 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
239 aa  126  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
1101 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
1120 aa  125  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 
320 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  39.49 
 
 
239 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  37.43 
 
 
321 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.69 
 
 
571 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 
258 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
291 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  39.38 
 
 
244 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  31.05 
 
 
327 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37.63 
 
 
250 aa  122  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
199 aa  122  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 
259 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
294 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  30.86 
 
 
488 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  36.73 
 
 
871 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  38.02 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 
542 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>