More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1074 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 320 aa  652    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0571  polysaccharide deacetylase  61.78 
 
 		 309 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  58.41 
 
 		 294 aa  278  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  51.9 
 
 		 344 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  51.29 
 
 		 271 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  50 
 
 		 267 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  51.52 
 
 		 260 aa  242  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  52.16 
 
 		 263 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  49.37 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  49.37 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  49.37 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  49.37 
 
 		 260 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  49.37 
 
 		 260 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  49.37 
 
 		 260 aa  239  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  49.37 
 
 		 260 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  49.37 
 
 		 260 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  50.21 
 
 		 260 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  49.37 
 
 		 260 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  46.75 
 
 		 345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  49.53 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  49.06 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  42.36 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 263 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.41 
 
 		 251 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  29.5 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 238 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  28.79 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  29.06 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  28.79 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 299 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 221 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  28.28 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  32.75 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  32.75 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  32.75 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.75 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  32.75 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  32.75 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000107726 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  32.75 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.47 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  32.31 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 		 522 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  35.07 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  32.75 
 
 		 254 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  32.34 
 
 		 360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 		 382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 537 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 258 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  32.34 
 
 		 261 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  32.84 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 		 258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  33.88 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.65 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  25.25 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 199 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 		 542 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 		 217 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 215 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.44 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 236 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.34 
 
 		 275 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31 
 
 		 258 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 465 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 212 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 228 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>