More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0811 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
239 aa  488  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  99.58 
 
 
239 aa  487  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0450  polysaccharide deacetylase  67.36 
 
 
235 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000380571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  56.72 
 
 
683 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  50.48 
 
 
308 aa  219  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  41.88 
 
 
465 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  39.9 
 
 
247 aa  135  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.97 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  39.49 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  37.7 
 
 
344 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  38.92 
 
 
417 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  39.49 
 
 
321 aa  124  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 
387 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  33.48 
 
 
264 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 
291 aa  118  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  36.04 
 
 
241 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 
368 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 
522 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.03 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 
217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  35.03 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  37.7 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
273 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  33.8 
 
 
488 aa  111  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 
503 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  36.32 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  30.51 
 
 
234 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
275 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 
276 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.33 
 
 
373 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  31.8 
 
 
234 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 
234 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  34.68 
 
 
468 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 
234 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 
234 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 
405 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 
234 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 
234 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  35.5 
 
 
373 aa  106  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  34.72 
 
 
287 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  36.44 
 
 
244 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  30.67 
 
 
234 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 
324 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
292 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 
258 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 
234 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
302 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  34.27 
 
 
1099 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 
305 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 
240 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 
234 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
307 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 
317 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 
204 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  34.87 
 
 
263 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.61 
 
 
1115 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  33.95 
 
 
1101 aa  101  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.76 
 
 
1115 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  36.76 
 
 
927 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  36.76 
 
 
1115 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  36.76 
 
 
1119 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  36.31 
 
 
252 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 
244 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  34.83 
 
 
354 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  35.15 
 
 
872 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 
1124 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 
235 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 
227 aa  98.6  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  33.69 
 
 
283 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 
269 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  32.51 
 
 
1120 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.8 
 
 
1115 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 
522 aa  96.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 
871 aa  96.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  31.94 
 
 
291 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  30.64 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  30.59 
 
 
240 aa  95.9  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  35.1 
 
 
479 aa  95.5  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  36 
 
 
372 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 
229 aa  95.5  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  32.73 
 
 
479 aa  95.1  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 
294 aa  95.1  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>