More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1224 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 392 aa  789    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  61.01 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  33.77 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0562  polysaccharide deacetylase  44.9 
 
 		 236 aa  143  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  34.76 
 
 		 243 aa  122  9e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  28.54 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 261 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  39.34 
 
 		 244 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 542 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  34.83 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  38.67 
 
 		 229 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 		 199 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  35.15 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 255 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  34.59 
 
 		 262 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35 
 
 		 468 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 232 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  33.88 
 
 		 305 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.83 
 
 		 251 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 217 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 242 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  36.26 
 
 		 267 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 		 232 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 503 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  29.83 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 		 213 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  34 
 
 		 244 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 220 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 258 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  34.16 
 
 		 241 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 241 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 520 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 241 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 213 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  34 
 
 		 217 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 213 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 213 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  33.05 
 
 		 264 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 307 aa  99.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 247 aa  99.4  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  33.85 
 
 		 275 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 		 204 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 221 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 275 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 353 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 302 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 287 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 263 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  31.44 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 		 248 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 275 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  31.05 
 
 		 258 aa  97.4  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.86 
 
 		 250 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  35.43 
 
 		 280 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 		 320 aa  97.4  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 		 252 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 275 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 275 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 275 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 275 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 275 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 		 256 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 285 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 		 248 aa  97.1  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 		 287 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.66 
 
 		 241 aa  96.3  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 233 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 		 258 aa  96.3  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 219 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.77 
 
 		 251 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  36.05 
 
 		 272 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 		 276 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 243 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  34.43 
 
 		 291 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  32.76 
 
 		 234 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 404 aa  94.4  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  30.74 
 
 		 234 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 		 264 aa  93.6  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  30.59 
 
 		 244 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0244  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 		 208 aa  93.6  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  35.65 
 
 		 354 aa  93.2  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 234 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  30.49 
 
 		 263 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  34.05 
 
 		 1099 aa  93.2  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 		 234 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  31.52 
 
 		 488 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  31.6 
 
 		 234 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>