More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3879 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 289 aa  592  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  37.72 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  34.16 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.18 
 
 		 251 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  35.61 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  38.26 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  41.58 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  37.58 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  38.42 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.69 
 
 		 373 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  39.07 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  38.26 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  39.07 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  39.07 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  42.77 
 
 		 542 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  40.13 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  37.58 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  37.58 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  37.09 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  37.5 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  39.16 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  38.41 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 		 503 aa  116  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  35.59 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  38.41 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  36.11 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 		 404 aa  113  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 241 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  36.46 
 
 		 241 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 387 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  34.46 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  33.9 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  33.9 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  32.86 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  33.9 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 		 465 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  33.89 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  36.94 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  39.26 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  38.85 
 
 		 302 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  39.1 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  38.96 
 
 		 233 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  37.95 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 		 522 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  36.05 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  40.85 
 
 		 409 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.73 
 
 		 372 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  34.46 
 
 		 217 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  37.01 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  33.89 
 
 		 244 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 		 307 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  39.13 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  39.77 
 
 		 1101 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  36.63 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  38.99 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  35.93 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 537 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  35.88 
 
 		 201 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 217 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 240 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  37.89 
 
 		 227 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  37.58 
 
 		 468 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 		 204 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 425 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 		 256 aa  99  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  36.88 
 
 		 246 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  33.88 
 
 		 345 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 		 204 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 752 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  31.09 
 
 		 373 aa  98.2  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  38.29 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.27 
 
 		 1115 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  34.12 
 
 		 927 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  37.27 
 
 		 1115 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  37.27 
 
 		 1119 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  36.88 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 336 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  37.22 
 
 		 1124 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  37.75 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  40.4 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  39.51 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>