More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0475 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 336 aa  674    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  45.98 
 
 		 692 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  56.25 
 
 		 1001 aa  206  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  52.33 
 
 		 767 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  94.19 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  36.46 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  38.12 
 
 		 227 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  37.24 
 
 		 465 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  36.26 
 
 		 465 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  37.43 
 
 		 199 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  35.91 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  35.36 
 
 		 387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  36.47 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 542 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  66.67 
 
 		 333 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  36.2 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  36.97 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 503 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.51 
 
 		 251 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 		 275 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 		 275 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.99 
 
 		 275 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1687  polysaccharide deacetylase  38.15 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000644335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  34.87 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 		 276 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  40.62 
 
 		 1099 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  39.87 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  37.06 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 275 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  35.22 
 
 		 405 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  59.52 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  37.8 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  32.5 
 
 		 238 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  35.63 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  35.91 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  31.34 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 255 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 		 317 aa  99.8  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 258 aa  99.8  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  32.39 
 
 		 279 aa  99  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  35.71 
 
 		 488 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.51 
 
 		 1115 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  32.93 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 289 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 262 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  33.9 
 
 		 259 aa  97.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  33.14 
 
 		 247 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  32.98 
 
 		 927 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 		 263 aa  96.3  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  32.98 
 
 		 1115 aa  96.3  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  32.98 
 
 		 1119 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.98 
 
 		 1115 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  52.81 
 
 		 451 aa  95.9  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  35.84 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01800  chitin deacetylase, putative  34.56 
 
 		 470 aa  95.5  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  33.92 
 
 		 468 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  36.78 
 
 		 272 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  30.64 
 
 		 204 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 413 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 522 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 		 752 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  42.24 
 
 		 242 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  35.43 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 204 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 259 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03490  chitin deacetylase-like mannoprotein MP98  31.89 
 
 		 458 aa  93.6  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  30.27 
 
 		 244 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 256 aa  93.2  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 		 520 aa  92.4  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 242 aa  92.4  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.1 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  31.94 
 
 		 872 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  37.36 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 221 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 430 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  31.91 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  33.88 
 
 		 372 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  33.33 
 
 		 373 aa  91.3  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 1124 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.94 
 
 		 1115 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 285 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 537 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 273 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  35.39 
 
 		 273 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>