More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND03490 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND03490  chitin deacetylase-like mannoprotein MP98  100 
 
 
458 aa  942    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01800  chitin deacetylase, putative  36.8 
 
 
470 aa  155  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61842  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03580  chitin deacetylase, putative  43.37 
 
 
410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322784  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 
542 aa  106  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
292 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43807  Chitin deacetylase 2 precursor  32.7 
 
 
269 aa  97.8  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0156185  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 
199 aa  94.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  34.86 
 
 
373 aa  94  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  33.54 
 
 
522 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  31.89 
 
 
336 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  36.81 
 
 
692 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 
503 aa  91.3  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 
537 aa  90.9  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 
258 aa  90.5  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.17 
 
 
468 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
1120 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  35.46 
 
 
320 aa  88.6  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  38.21 
 
 
352 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 
267 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  40.32 
 
 
1001 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  28.29 
 
 
263 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  29.83 
 
 
237 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  39.52 
 
 
287 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 
522 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.04 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  40.16 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  29.48 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1573  polysaccharide deacetylase  37.59 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
256 aa  84  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  30 
 
 
291 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  31.52 
 
 
291 aa  84  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
273 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 
465 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  35.61 
 
 
240 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  35.77 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.04 
 
 
275 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  34.97 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  34.68 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 
520 aa  79.7  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  37.01 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
272 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00270  deacetylase, putative  33.68 
 
 
253 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 
275 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.88 
 
 
251 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 
275 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.76 
 
 
1115 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  33.6 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  31.76 
 
 
465 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 
337 aa  76.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 
275 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
229 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  31.18 
 
 
1115 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  31.18 
 
 
1119 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.18 
 
 
1115 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01852  Chitin deacetylasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.41); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BC78]  29.55 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  31.18 
 
 
927 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  36.72 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  31.39 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  29.53 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  36.8 
 
 
767 aa  74.3  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  30.06 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  36.07 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 
275 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 
273 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 
268 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 
235 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  26.87 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  34.13 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  34.13 
 
 
275 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>