More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3696 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 321 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  85.67 
 
 		 315 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  57.82 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  55.35 
 
 		 295 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  55.35 
 
 		 295 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  55.35 
 
 		 295 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  54.89 
 
 		 288 aa  317  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  57.92 
 
 		 264 aa  316  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  56.25 
 
 		 289 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  56.25 
 
 		 289 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  56.25 
 
 		 289 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  39.92 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  35.25 
 
 		 307 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  34.92 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  38.43 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  34.92 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  34.92 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  34.58 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  33.44 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  37.18 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  40.16 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  38.01 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  39.05 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  33.95 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  35.69 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.41 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  31.64 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  35.47 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  34.94 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  35.77 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 281 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  34.14 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  33.73 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  32.52 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  33.75 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  32.93 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  32.4 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  32 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  31.71 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  31.3 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  27.99 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  28.52 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  27.89 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  27.89 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  27.74 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  27.37 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  27.74 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  27.74 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  29.51 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3184  putative polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  27.4 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  27.49 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  27.02 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  27.49 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  27.49 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  27.49 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  30.18 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 		 317 aa  96.3  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  27.97 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  27.93 
 
 		 308 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  27.49 
 
 		 317 aa  95.9  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  27.84 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  27.15 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  27.15 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  27.49 
 
 		 308 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  27.49 
 
 		 308 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.12 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2094  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 		 309 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  26.62 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  25.69 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  25.69 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  25.43 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>