More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2238 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 289 aa  581  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  33.07 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  28.95 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  30.87 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  32.19 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  28.75 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  28.57 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 293 aa  95.9  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  33.92 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  28.63 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  26.87 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  30.11 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  31.49 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  31.54 
 
 		 273 aa  93.2  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 		 279 aa  92.4  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  30.22 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 310 aa  89  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  32.95 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  27.42 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  29.92 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  29.2 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0213  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.497622 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  25.19 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  39.82 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  39.82 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  39.82 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1784  hypothetical protein  28.57 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  25.7 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  26.99 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  31.73 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1330  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1349  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  44.44 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  33.63 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.01 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  34.88 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  33.6 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  43.53 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  36.54 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0518  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  41.77 
 
 		 1099 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  36.54 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  41.46 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 		 430 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  36.9 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  41.18 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  35.8 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  37.08 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  33.75 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  41.98 
 
 		 1101 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  33.72 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  30.09 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  29.81 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  29.93 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1313  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.31 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>