More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1074 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  84.7 
 
 		 281 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  43.01 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  41.27 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  42.33 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  44.5 
 
 		 312 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  42.33 
 
 		 346 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  42.92 
 
 		 313 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  41.27 
 
 		 348 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  43.01 
 
 		 350 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  41.18 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 322 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  42.41 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  40.2 
 
 		 308 aa  142  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 		 430 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  38.43 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 		 321 aa  132  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 		 440 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  37.63 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 439 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  38.74 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 871 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 		 439 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  35.57 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 393 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  37.95 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 324 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 		 267 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 890 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.85 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  32.35 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 368 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 428 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  30.53 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 898 aa  105  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  28.06 
 
 		 927 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  28.06 
 
 		 1115 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  28.06 
 
 		 1119 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.06 
 
 		 1115 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.55 
 
 		 1115 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  33.95 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  31.72 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  27.55 
 
 		 872 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 221 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.04 
 
 		 1115 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 320 aa  96.7  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 503 aa  95.9  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.05 
 
 		 373 aa  95.5  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 372 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 		 321 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.06 
 
 		 251 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  27.13 
 
 		 468 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  31.63 
 
 		 903 aa  93.6  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 900 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 		 387 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 		 752 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  32.78 
 
 		 227 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 1101 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  27.69 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  32.16 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  27.69 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01852  Chitin deacetylasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.41); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BC78]  31.89 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  27.46 
 
 		 211 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 542 aa  90.5  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 		 479 aa  90.1  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.85 
 
 		 1099 aa  89.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  32.42 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 		 465 aa  89.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 251 aa  89  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 275 aa  89  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 242 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 465 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 1120 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5477  polysaccharide deacetylase  27.89 
 
 		 206 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 		 522 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  29.08 
 
 		 479 aa  86.3  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  27.55 
 
 		 258 aa  85.9  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  28.25 
 
 		 692 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 		 1154 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  27.37 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>