28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1116 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1116  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  728    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1140  hypothetical protein  48.7 
 
 
348 aa  345  6e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1110  hypothetical protein  47.83 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.506924  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0383  hypothetical protein  38.62 
 
 
342 aa  246  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3172  hypothetical protein  30.49 
 
 
304 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4421  hypothetical protein  28.34 
 
 
420 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  0.170958 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2497  hypothetical protein  30.1 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3424  hypothetical protein  28.81 
 
 
358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0581  polysaccharide deacetylase  31.76 
 
 
470 aa  129  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1371  hypothetical protein  31.05 
 
 
470 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0766  hypothetical protein  28.25 
 
 
423 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.249559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1832  hypothetical protein  28.67 
 
 
280 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1559  hypothetical protein  26.51 
 
 
478 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462896  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1599  hypothetical protein  29.3 
 
 
466 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3968  hypothetical protein  28.71 
 
 
501 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0443888 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1737  hypothetical protein  28.39 
 
 
469 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1128  hypothetical protein  24.73 
 
 
495 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0814  hypothetical protein  24.1 
 
 
485 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0883  hypothetical protein  26.87 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.985622 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05615  hypothetical protein  22.26 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.776737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.75 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 
293 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  26.54 
 
 
273 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0213  polysaccharide deacetylase  25.65 
 
 
218 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.497622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>