More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1710 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 427 aa  852    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  72.09 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  60.75 
 
 		 430 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  58.97 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  56.55 
 
 		 439 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  55.31 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  64.15 
 
 		 393 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  48.56 
 
 		 269 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  48.44 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  45.41 
 
 		 270 aa  193  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  42.97 
 
 		 265 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  43.4 
 
 		 293 aa  187  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  47.21 
 
 		 256 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  42.92 
 
 		 350 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 		 348 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  40.27 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  39.06 
 
 		 346 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  42.11 
 
 		 265 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  41.35 
 
 		 321 aa  179  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  41.96 
 
 		 310 aa  177  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  39.37 
 
 		 313 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  40.18 
 
 		 308 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  38.65 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  38.91 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  42.66 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  40.18 
 
 		 260 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  40.57 
 
 		 267 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  39.55 
 
 		 345 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 280 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  31.73 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 		 305 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 		 503 aa  98.2  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 285 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.99 
 
 		 417 aa  94.4  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 		 352 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 273 aa  93.6  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 300 aa  90.9  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 		 273 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 		 302 aa  90.5  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 		 387 aa  90.1  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 		 267 aa  90.1  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.38 
 
 		 251 aa  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 273 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  32.93 
 
 		 301 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  29.79 
 
 		 275 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  29.47 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 275 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 275 aa  87.8  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  29.79 
 
 		 275 aa  87.8  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 277 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 275 aa  87.8  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  30.59 
 
 		 215 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 275 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 275 aa  87.4  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  28.19 
 
 		 275 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.5 
 
 		 241 aa  86.3  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.48 
 
 		 1120 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 		 354 aa  86.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  34.98 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 		 217 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 		 1002 aa  85.5  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 		 220 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  31.68 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  31.84 
 
 		 573 aa  83.2  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.68 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.83 
 
 		 752 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  36.51 
 
 		 683 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  34.38 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 		 240 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 245 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>