More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3077 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  79.09 
 
 		 439 aa  676    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 440 aa  885    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  65.15 
 
 		 439 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  65.79 
 
 		 430 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  60.39 
 
 		 428 aa  463  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  61.25 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  54.59 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  47.2 
 
 		 269 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  44.96 
 
 		 297 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  45.34 
 
 		 270 aa  189  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  46.12 
 
 		 256 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  41.46 
 
 		 265 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  40.08 
 
 		 321 aa  179  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  41.59 
 
 		 345 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  43.59 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  42.92 
 
 		 350 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  37.94 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  42.11 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  39.27 
 
 		 260 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  42.26 
 
 		 265 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  38.96 
 
 		 348 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  37.65 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  43.1 
 
 		 267 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 		 313 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 322 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  39.3 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 312 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  37.56 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  36.68 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 		 280 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  32.21 
 
 		 281 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.99 
 
 		 373 aa  104  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.68 
 
 		 251 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 		 305 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 		 320 aa  101  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.87 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 302 aa  99.8  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 275 aa  99.8  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 275 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 275 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.62 
 
 		 275 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.62 
 
 		 275 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 275 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 275 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 324 aa  98.2  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  39.57 
 
 		 503 aa  97.8  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 273 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  33.86 
 
 		 273 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 273 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 273 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 273 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 273 aa  96.3  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 273 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 275 aa  96.3  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 273 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  32.93 
 
 		 301 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 273 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 260 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 273 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 		 321 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 		 275 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  28.35 
 
 		 273 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  31.38 
 
 		 275 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 272 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 273 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 		 244 aa  94.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 352 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 387 aa  94  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 		 1120 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 300 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  33.12 
 
 		 299 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  37.57 
 
 		 542 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  37.19 
 
 		 354 aa  91.3  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 890 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 273 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  34.83 
 
 		 1124 aa  90.5  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 272 aa  89.7  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  27.57 
 
 		 279 aa  89.7  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  34.38 
 
 		 1099 aa  89.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 292 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 		 900 aa  89  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 		 259 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  26.12 
 
 		 903 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.17 
 
 		 1115 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  34.17 
 
 		 1115 aa  87.8  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  34.17 
 
 		 1119 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 204 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 		 273 aa  87.4  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  34.17 
 
 		 927 aa  87  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 368 aa  86.7  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 		 344 aa  87  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 465 aa  86.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 256 aa  86.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  32 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>