More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0282 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  100 
 
 		 350 aa  716    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  71.1 
 
 		 312 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  70.77 
 
 		 313 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  69.66 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  57.83 
 
 		 311 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  70 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  70.04 
 
 		 310 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  67.05 
 
 		 260 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  61.98 
 
 		 346 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  61.22 
 
 		 356 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  60.67 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  61.15 
 
 		 348 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  55.33 
 
 		 345 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  43.84 
 
 		 430 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  42.29 
 
 		 427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  42.92 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  42.5 
 
 		 440 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  40.07 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  40.26 
 
 		 321 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  42.47 
 
 		 428 aa  169  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  42.19 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  41.3 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  40.25 
 
 		 393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  38.16 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  39.63 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  40.62 
 
 		 267 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  40.62 
 
 		 265 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  42.73 
 
 		 270 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  43.01 
 
 		 280 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 265 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  41.97 
 
 		 281 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  34.22 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 		 299 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  35.52 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.14 
 
 		 251 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  29.05 
 
 		 373 aa  96.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 352 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 256 aa  96.3  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 503 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 		 387 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 		 890 aa  93.6  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 		 368 aa  93.2  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.51 
 
 		 417 aa  92.4  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 247 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  32.1 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 283 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  27.87 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 		 898 aa  89.7  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  30.05 
 
 		 488 aa  90.1  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 		 258 aa  89.7  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.92 
 
 		 468 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 520 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 261 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  30.16 
 
 		 279 aa  87  4e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  33.69 
 
 		 204 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 		 317 aa  87  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  31.18 
 
 		 259 aa  87  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 413 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 242 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 		 300 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 542 aa  83.6  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 1120 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 		 871 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 1124 aa  82.8  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 		 900 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.74 
 
 		 1115 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.23 
 
 		 1115 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  29.23 
 
 		 1119 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.23 
 
 		 1115 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  26.56 
 
 		 903 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5072  polysaccharide deacetylase  32.02 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0244  polysaccharide deacetylase  36.81 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  29.38 
 
 		 244 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  30.35 
 
 		 264 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  28.4 
 
 		 235 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 		 215 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>