More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5072 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5072  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
355 aa  723    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  32.07 
 
 
890 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 
405 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 
275 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  30.68 
 
 
356 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  27.16 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  32.78 
 
 
294 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 
542 aa  94  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
348 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
898 aa  93.6  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  26.99 
 
 
324 aa  93.6  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 
258 aa  93.6  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  27.51 
 
 
871 aa  93.2  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  29.7 
 
 
275 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 
275 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 
275 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 
276 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 
317 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 
275 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  34.97 
 
 
212 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 
275 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 
387 aa  91.3  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  30.81 
 
 
903 aa  90.9  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  29.51 
 
 
417 aa  90.1  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
900 aa  89.7  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 
267 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 
283 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  27.93 
 
 
373 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 
285 aa  89.4  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 
270 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
217 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  31.61 
 
 
1115 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 
312 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.81 
 
 
1115 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  31.61 
 
 
1119 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 
413 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 
1124 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 
232 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.61 
 
 
1115 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 
413 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  33.89 
 
 
352 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  28.73 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 
346 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 
265 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 
311 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  31.25 
 
 
259 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.91 
 
 
1115 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  26.84 
 
 
522 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 
313 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
356 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 
286 aa  86.7  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 
308 aa  86.3  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 
310 aa  86.3  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 
372 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32.73 
 
 
299 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 
269 aa  86.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 
219 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.32 
 
 
251 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  29.78 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 
215 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  31.61 
 
 
927 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.69 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  30.73 
 
 
872 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  32.93 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
256 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
1002 aa  83.6  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  30.06 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  28.26 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  31.8 
 
 
1118 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  26.79 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  26.21 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 
258 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 
277 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 
284 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  25.59 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
213 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
241 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
1120 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  25.95 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 
503 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  32.95 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>