More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0697 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 297 aa  591  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  60.8 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  57.2 
 
 		 270 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  52.57 
 
 		 269 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  51.59 
 
 		 256 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  52.38 
 
 		 265 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  53.39 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  51.52 
 
 		 265 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  48.1 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  48.44 
 
 		 427 aa  199  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  44.79 
 
 		 440 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  42.2 
 
 		 430 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  43.41 
 
 		 439 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  47.14 
 
 		 439 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  46.18 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  43.22 
 
 		 393 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  41.7 
 
 		 345 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  40.89 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  40.89 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  39.57 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 		 356 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  37.66 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  39.57 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  40.64 
 
 		 307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  38.05 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  35.57 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 		 1124 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  35.55 
 
 		 246 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 387 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  31.82 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 324 aa  96.3  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  29.69 
 
 		 373 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  31.92 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.92 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  31.92 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  31.92 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  31.54 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.54 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  33.19 
 
 		 1120 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 		 275 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 263 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.44 
 
 		 251 aa  92.8  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 275 aa  92.4  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 503 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  33.19 
 
 		 242 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 352 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 520 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  31.05 
 
 		 275 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  29.84 
 
 		 468 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  50.65 
 
 		 275 aa  89  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 302 aa  89  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  50.65 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  50.65 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  50.65 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 273 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  50.65 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 217 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.65 
 
 		 927 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  50.65 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.65 
 
 		 1115 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  29.65 
 
 		 1119 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.65 
 
 		 1115 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.69 
 
 		 344 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5072  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 355 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.56 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 292 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 430 aa  86.3  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 		 1002 aa  86.3  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 		 413 aa  86.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  50.65 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  34.03 
 
 		 683 aa  85.9  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 277 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 256 aa  85.5  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  29.1 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  32.82 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>