More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2378 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 265 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  78.87 
 
 		 265 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  71.66 
 
 		 267 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  66.95 
 
 		 293 aa  324  8.000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  63.67 
 
 		 256 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  61.38 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  54.77 
 
 		 270 aa  232  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  51.3 
 
 		 297 aa  224  9e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  48.07 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  43.09 
 
 		 427 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  42.92 
 
 		 439 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  42.56 
 
 		 440 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  42 
 
 		 428 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  43.67 
 
 		 439 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  41.87 
 
 		 430 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  42.91 
 
 		 393 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  42.22 
 
 		 312 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  41.7 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  40.44 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 345 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  39.91 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  40.09 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  38.74 
 
 		 356 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  40.62 
 
 		 350 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  40.09 
 
 		 346 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  39.38 
 
 		 348 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  40.36 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  40.99 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  37.87 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  37.05 
 
 		 307 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  38.74 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  36.56 
 
 		 352 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 520 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 387 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  33.65 
 
 		 405 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 221 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 413 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  33.94 
 
 		 237 aa  92  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 522 aa  92  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  30.2 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  31.77 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  35.63 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  42.14 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 204 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 		 1124 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  42.14 
 
 		 276 aa  89.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  41.43 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  41.43 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  33.89 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  42.14 
 
 		 275 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 300 aa  89  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  42.14 
 
 		 275 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  42.14 
 
 		 275 aa  88.6  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  42.14 
 
 		 275 aa  89  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  40.15 
 
 		 242 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 273 aa  89  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5072  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 355 aa  88.6  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.26 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  31.89 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 321 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  31.11 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  42.14 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 372 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.25 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.25 
 
 		 275 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 		 537 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 301 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  35.53 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 292 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 503 aa  85.5  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.07 
 
 		 1120 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 275 aa  85.5  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  37.57 
 
 		 246 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.07 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  33.51 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>