More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0538 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 323 aa  666    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  38.76 
 
 		 238 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  38.14 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  41.42 
 
 		 503 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3126  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000165534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 		 331 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  38.28 
 
 		 238 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  34.93 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 274 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  34.93 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  30.43 
 
 		 254 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1863  polysaccharide deacetylase family protein  32.35 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00543619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1582  polysaccharide deacetylase family protein  32.35 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00773707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5292  putative polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 245 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000730048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5323  putative polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4896  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2070  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  34.63 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4996  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 245 aa  99.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 		 413 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1521  polysaccharide deacetylase family protein  28.85 
 
 		 332 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0654867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.73 
 
 		 280 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1802  polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.12203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3196  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase A  32.84 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2908  polysaccharide deacetylase  32.86 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.850515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 244 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1758  polysaccharide deacetylase family protein  33.17 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00010235  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  29.65 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  31.66 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 275 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 275 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 275 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  28.97 
 
 		 275 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  28.97 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 275 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 273 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  31.1 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  28.97 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 273 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 260 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 280 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0080  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  37.5 
 
 		 162 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 		 273 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 		 273 aa  89  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  30.27 
 
 		 260 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 522 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 258 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 272 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  31.52 
 
 		 300 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 273 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 287 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 287 aa  85.9  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  31.66 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  27.51 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  32.16 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 1120 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 479 aa  82.8  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  30 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0450  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 235 aa  82  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000380571  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  27.55 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 542 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.31 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.78 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  31.93 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  31.92 
 
 		 573 aa  80.5  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  27.84 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>